Die Warm-ups für die Rennen in Sepang sahen durchwegs Favoriten vorne. Nach ein wenig Regen über Nacht und bei bewölkten Bedingungen konnte Gabor Talmacsi in der 125er-Klasse die beste Zeit verbuchen, wobei sein Titelkonkurrent und Polesetter Hector Faubel nur auf Platz neun kam. Eine gute Leistung zeigte Sandro Cortese, der mit lediglich 19 Tausendstel Rückstand Platz zwei erreichte. Michael Ranseder war nach dem Aufwärmtraining auf Platz 13 zu finden, Stefan Bradl hatte die 18. Zeit herausgefahren. Dominique Aegerter und Randy Krummenacher kamen auf 24 und 25.

In der 250er-Klasse war erwartungsgemäß Jorge Lorenzo vorne, obwohl der Spanier am Samstag die Pole Position gegen die beiden KTMs verpasst hatte. Die lagen auf den Plätzem drei (Mika Kallio) und sechs (Hiroshi Aoyama). Ebenfalls vorne dabei, Marco Simoncelli als Zweiter, Alvaro Bautista als Vierter und Andrea Dovizioso als Fünfter. Die Mannschaft von Kiefer Racing hatte einen guten Auftakt in den Sonntag. Sowohl Alex Baldolini als auch Dirk Heidolf konnten ansprechende Zeiten fahren und fanden sich nach Ablauf der Session auf den Rängen 13 und 14.

In der MotoGP war es eine Angelegenheit zwischen Casey Stoner und Dani Pedrosa, wie bereits im Qualifying. Diesmal hatte aber der Australier die Nase vorne - und das gleich um beinahe vier Zehntel. Marco Melandri, John Hopkins und Nicky Hayden kamen auf die Ränge drei bis fünf. Ebenfalls noch in den Top Ten fanden sich Randy de Puniet, Loris Capirossi, Toni Elias, Chris Vermeulen und Anthony West. Valentino Rossi konnte nicht den erhofften Sprung nach vorne machen und wurde mit rund 1,2 Sekunden Rückstand Elfter.