Peter Bayer wurde am 06. Jänner 1971 in Au in Vorarlberg (Österreich) geboren. Er absolvierte ein Studium der Betriebswirtschaftslehre (BWL) in Innsbruck.
In seiner frühen Karriere war Bayer im Wintersport und Eventbereich tätig, etwa mit der International Snowboard Federation. Er war auch an der Organisation von Events, Musikfestivals und der Verbindung von Sport & Kultur beteiligt. 2012 war er der CEO der Olympischen Jugend-Winterspiele. Zudem engagierte er sich bei Projekten im Hochseesegeln (z.B. America's Cup).
Im März 2017 wurde Bayer zum Generalsekretär Sport der FIA ernannt. In dieser Position war er verantwortlich für zahlreiche Motorsportdisziplinen weltweit - von Kart bis zur Formel 1. Ab 2021 übernahm er dazu noch die Rolle des Executive Director für die Formel-1-Organisation in der FIA.
Am 1. Juni 2022 verließ Bayer die FIA und trat bei Red Bull/Racing Bulls ein, wo er im Juni 2023 zum CEO des Red Bull Juniorteams ernannt wurde. In seiner Rolle bei den Racing Bulls verantwortet er die strategische Ausrichtung des Teams, während Teamchef Alan Permane das operative Tagesgeschäft leitet. Unter seiner Leitung wurden Aspekte wie die Teamidentität, neue Logos, Sponsorstrategien und technische Entwicklungen umgesetzt.