Bei nassen Bedingungen ging das erste Training der 125er in Motegi in Szene. Dabei behielt Andrea Iannone in 2.12.589 die Oberhand. Der Italiener lag damit rund eine Sekunde vor KTM-Pilot Tomoyoshi Koyama und Danny Webb. Die Top Fünf wurden von Koyamas Teamkollegen Lorenzo Zanetti und dem Derbi-Fahrer Pol Espargaro abgerundet. Zanetti war einer jener Piloten, der bei den schwierigen Bedingungen zu Sturz kam. Ebenfalls erwischt hatte es Gabor Talmacsi, der hinter Raffaele de Rosa und Simone Corsi Achter wurde.

Auch in die Top Ten geschafft hatte es Michael Ranseder, der sich den neunten Platz sichern konnte. Joan Olive komplettierte die besten Zehn. Sandro Cortese fuhr auf Rang 16, Stefan Bradl wurde 20. und Jonas Folger, der ebenfalls einen leichten Sturz hatte, lag einen Platz dahinter. Dominique Aegerter war auf Position 25 zu finden und Robin Lässer erreichte den 35. Platz. Der Kiefer-Pilot war auch eines der Sturzopfer, so wie auch noch Pablo Nieto, Robert Muresan und Marc Marquez. Alle Ausritte blieben aber ohne Folgen.