Hiroshi Aoyama hat sich auch das zweite 250cc-Training in Sepang gesichert und ist damit der Favorit auf das Qualifying am Samstagnachmittag. Der in der WM-Führung liegende Japaner brauchte 2:07.160 Minuten für seinen schnellsten Umlauf und lag damit doch recht klar vor der Konkurrenz. Hector Barbera auf Platz zwei wies bereits mehr als drei Zehntelsekunden Rückstand auf Aoyama auf.

Am genauesten beobachtet wurde aber, wie sich Marco Simoncelli im Vergleich zum WM-Leader schlagen würde, immerhin ist der Italiener sein erster Herausforderer im Kampf um den Titel. Und Simoncelli konnte sich im Vergleich zum Freitag ordentlich steigern. Statt Platz zehn stand diesmal Rang drei zu Buche, wobei der Abstand zur Bestzeit von 1,2 auf rund 0,6 Sekunden halbiert wurde. Aoyama dürfte das Ergebnis trotzdem gefallen haben, denn solange er dieses Wochenende vor Simoncelli bleibt, stehen seine Chancen auf den Titel bestens.

Auf den Positionen vier bis sieben hatten Mattia Pasini, Raffele de Rosa, Ratthapark Wilairot und Mike di Meglio das Training beendet. Diese Vier lagen alle noch innerhalb einer Sekunde hinter der Bestzeit. Hector Faubel war auf Platz acht als Erster mehr als eine Sekunde von Aoyamas Zeit weg. Der Spanier musste allerdings in den letzten Trainingsminuten auch einen Sturz hinnehmen. Ebenfalls gestürzt war Alvaro Bautista, er hatte zu dem Zeitpunkt allerdings noch 20 Minuten übrig, konnte also noch auf seine Ersatzmaschine hüpfen. Über Platz elf, hinter Alex Debon und Thomas Lüthi, kam er aber nicht hinaus.

Keine Ersatzmaschine hatte Vladimir Leonov, den es nach nur sieben Minuten erwischte. Der Russe des Kiefer-Teams musste danach zusehen und konnte keine Rundenzeit fahren. Im zweiten deutschen Team gab es keine derartigen Zwischenfälle. Shuhei Aoyama vom Racing Team Germany legte 21 Runden zurück und landete auf dem 18. Platz - 2,3 Sekunden hinter seinem Bruder an der Spitze.