Mit nur 0,017 Sekunden Vorsprung auf seinen Teamkollegen ging die Pole an Joan Lascorz. Katsuaki Fujiwara hatte zwar die meiste Zeit der Session geführt, doch konnte er die Pole nicht halten. Der letzte Angriff seines Kawasaki-Teamkollegens saß und er musste sich hauchdünn geschlagen geben.

Startplatz drei ging an Eugene Laverty. Der Ire hatte allerdings reichlich fünf Minuten vor Schluss einen Sturz zu verzeichnen und konnte keine finale Attacke mehr platzieren. Das Vorderrad rutschte weg, Laverty blieb unverletzt.

Kawasaki-Pilot Fabien Foret und Titelaspirant Kenan Sofuoglu rundeten die Top Five ab, Michele Pirro, Gino Rea und Chaz Davies klassierten sich dahinter. Robbin Harms und Michel Praia machten die Top-Ten komplett. Massimo Roccoli hatte in diesem zweiten Qualifying gleich zwei Stürze zu verbuchen. Rang 14 am Ende für ihn.

WorldSSP, 2. Qualifying, Brünn:

1 26 Lascorz J. (ESP) Kawasaki ZX-6R 2'02.800
2 37 Fujiwara K. (JPN) Kawasaki ZX-6R 2'02.817
3 50 Laverty E. (IRL) Honda CBR600RR 2'03.082
4 99 Foret F. (FRA) Kawasaki ZX-6R 2'03.193
5 54 Sofuoglu K. (TUR) Honda CBR600RR 2'03.397
6 51 Pirro M. (ITA) Honda CBR600RR 2'03.421
7 4 Rea G. (GBR) Honda CBR600RR 2'03.450
8 7 Davies C. (GBR) Triumph Daytona 675 2'03.641
9 127 Harms R. (DEN) Honda CBR600RR 2'03.757
10 117 Praia M. (POR) Honda CBR600RR 2'03.959
11 25 Salom D. (ESP) Triumph Daytona 675 2'04.157
12 14 Lagrive M. (FRA) Triumph Daytona 675 2'04.445
13 31 Iannuzzo V. (ITA) Triumph Daytona 675 2'04.549
14 55 Roccoli M. (ITA) Honda CBR600RR 2'04.849
15 5 Lundh A. (SWE) Honda CBR600RR 2'05.504
16 8 Chesaux B. (SUI) Honda CBR600RR 2'05.673
17 85 Palumbo A. (ITA) Kawasaki ZX-6R 2'05.770
18 9 Dell'Omo D. (ITA) Honda CBR600RR 2'06.091
19 32 Holubec T. (CZE) Honda CBR600RR 2'06.306
20 22 Bukowski D. (POL) Honda CBR600RR 2'06.336
21 88 Cerny J. (SVK) Yamaha YZF R6 2'06.620
22 74 Skubic B. (SLO) Yamaha YZF R6 2'09.288
23 24 Blokhin E. (RUS) Yamaha YZF R6 2'10.220
24 10 Toth I. (HUN) Honda CBR600RR 2'10.248