Als abseits des Rennsports eher zurückhaltender Mensch gibt Casey Stoner nicht viel von seinem Privatleben preis. Gut bekannt ist, dass er seit 2007 mit seiner Frau Adriana verheiratet ist, die er 2003 kennenlernte, als er ihr ein Autogramm auf den Bauch geben sollte.

Sie ist seine ständige Begleiterin bei den Rennen und fungierte lange als sein Umbrella Girl, wenn er in der Startaufstellung stand. Vor Saisonbeginn 2012 wurden Adriana und Stoner zum ersten Mal Eltern. Ihre Tochter Alessandra wurde ausgerechnet am Geburtstag von Valentino Rossi geboren.

Seine Zelte hat Stoner momentan in Monaco aufgeschlagen, wo er die meiste Zeit des Jahres lebt, nach Australien kommt er dank des engen Motorrad-Terminkalenders nicht so oft, wie er möchte. In der Motorsport-Welt hat der Honda-Pilot einige sehr bekannte Freunde. So ist er etwa mit Formel-1-Star Kimi Räikkönen eng befreundet, den er 2007 bei Wrooom in Madonna di Campiglio kennenlernte, das Ferrari und Ducati immer zusammen im Januar eines Jahres veranstalten. Damals meinte Räikkönen, Stoner könne Weltmeister werden, im nächsten Jahr trafen sie sich dort beide als Weltmeister wieder.

Fernando Alonso lernte der Australier 2010 bei Wrooom kennen und schlug den Spanier bei einem Eisrennen in einem Fiat Panda, woraufhin der Spanier feststellte, dass Stoner sich schnell an das Arbeitsgerät mit vier Rädern anpasste. Und auch Michael Schumacher kennt der Australier gut. Als der Formel-1-Rekordweltmeister 2008 Stoners Ducati testen durfte, stand ihm der Zweirad-Könner hilfreich zur Seite und gab ihm ein paar Tipps zur Maschine.