Da sich die Bedingungen am Samstag in Estoril auch nach längerem Zuwarten nicht verbesserten, entschied die Rennleitung knapp vor 14:30 Ortszeit (15:30 MESZ), alle Qualifyings abzusagen. Damit werden die Startaufstellungen der Klassen anhand der Zeiten aus dem freien Training ermittelt. In der MotoGP bedeutet das, Jorge Lorenzo erhält aufgrund seiner Zeit vom Freitagnachmittag die Pole Position. Zusammen mit dem Spanier werden Nicky Hayden und Valentino Rossi aus Reihe eins starten.

In der zweiten Reihe des MotoGP-Rennens werden Casey Stoner, Ben Spies und Marco Melandri Aufstellung nehmen. Reihe drei besetzen am Sonntag Andrea Dovizioso, Randy de Puniet und Colin Edwards. Das nächste Trio bilden Marco Simoncelli, Aleix Espargaro und Dani Pedrosa. Loris Capirossi, Alvaro Bautista und Hector Barbera stehen in Reihe fünf. Das Ende des Feldes werden Hiroshi Aoyama und Carlos Checa bilden.