Drei-Viertel ihres zweiten Trainings konnten die Moto3-Piloten am Freitagnachmittag in Malaysia normal ausfahren, dann schlug der für Sepang typische Nachmittags-Niederschlag zu und beendete die Jagd nach guten Setups und Zeiten. Bis dahin hatte sich Jonas Folger in 2:15.038 Minuten am schnellsten um die Runde bewegt und sich damit auch die Tagesbestzeit gesichert. Im Vergleich zum Morgen war Folgers Vorsprung auf die Konkurrenz geschrumpft, WM-Spitzenreiter Sandro Cortese lag als Zweiter lediglich 0,241 Sekunden hinter seinem Landsmann.

Cortese konnte die Sache aber ohnehin recht entspannt angehen. Da sich sein erster WM-Verfolger Maverick Vinales in Malaysia spontan von seinem Team getrennt hat und die letzten Saisonrennen nicht bestreiten wird, ist der Deutsche beinahe Weltmeister. Er darf in Sepang nur nicht mehr als zehn Punkte auf Luis Salom einbüßen und es ist geschafft. Salom war im zweiten Training Achter, zwischen ihm und Cortese waren noch Zulfahmi Khairuddin, Miguel Oliveira, Alessandro Tonucci, Louis Rossi und Romano Fenati gelandet.

Zeitlich betrachtet war Salom weit von Cortese weg, eine Sekunde trennte die Beiden. Hinter dem Spanier waren Alex Rins und Danny Kent in die Top-10 gefahren. Toni Finsterbusch beendete die Session auf dem 24. Rang, Giulian Pedone war 26. und Luca Amato einen Platz dahinter. Stürze hatte es während der Session zwei gegeben, die Abflüge von Alberto Moncayo und Miguel Oliveira gingen aber glimpflich aus, wobei Oliveira bei seinem Sturz beinahe Salom mit abräumte; der Spanier wich durchs Kiesbett aus.