In der zweiten Qualifikation der STK1000-Piloten sicherte sich Sylvain Barrier mit einer 2:03.343 die Pole-Position vor Jeremy Guaroni, der das Regen-Training am Morgen noch dominiert hatte. Guaroni musste sich mit vier Zehntelsekunden Rückstand mit Rang zwei abfinden. Christoffer Bergmann überraschte mit starker Rundenzeit als Dritter.

Bryan Staring angelte sich den letzten Startplatz in der ersten Reihe und schob Lorenzo Baroni damit in Reihe zwei. Ondrej Jezek, der bereits im Training stark fuhr, qualifizierte sich für den sechsten Rang vor Eddi La Marra und Lorenzo Savadori. Letzterer war der erste Pilot, der über eine Sekunde Rückstand auf Barrier hatte. Kev Coghlan und Markus Reiterberger komplettierten die Top-10.

STK1000, Brünn, 2. Qualifikation

1. Sylvain Barrier (BMW Motorrad Italia GoldBet) BMW S1000 RR 2:03.343
2. Jeremy Guarnoni (MRS) Kawasaki ZX-10R 2:03.744
3. Christoffer Bergman (BWG Racing Kawasaki) Kawasaki ZX-10R 2:03.945
4. Bryan Staring (Team Pedercini) Kawasaki ZX-10R 2:04.069
5. Lorenzo Baroni (BMW Motorrad Italia GoldBet) BMW S1000 RR 2:04.100
6. Ondrej Jezek (SK Energy Racing Team) Ducati 1098R 2:04.291
7. Eddi La Marra (Barni Racing Team Italia) Ducati 1199 Panigale 2:04.392
8. Lorenzo Savadori (Barni Racing Team Italia) Ducati 1199 Panigale 2:04.688
9. Kev Coghlan (DMC Racing) Ducati 1199 Panigale 2:04.879
10. Markus Reiterberger (Team Alpha Racing) BMW S1000 RR 2:04.894
11. Matthieu Lussiana (Team ASPI) Kawasaki ZX-10R 2:04.981
12. Fabio Massei (EAB Ten Kate Junior Team) Honda CBR1000RR 2:05.076
13. Tomas Svitok (SK Energy Racing Team) Ducati 1098R 2:05.173
14. David McFadden (Team Pedercini) Kawasaki ZX-10R 2:05.277
15. Alen Gyorfi (MetalCom-Adrenalin H-Moto) Honda CBR1000RR 2:05.840
16. Marco Bussolotti (SK Energy Racing Team) Ducati 1098R 2:06.000
17. Eeki Kuparinen (Motomarket Racing) BMW S1000 RR 2:06.185
18. Andrzej Chmielewski (Red Devils Roma) Ducati 1098R 2:06.207
19. Tiago Dias (Team Dias) Kawasaki ZX-10R 2:06.221
20. Jan Halbich (Jan Halbich) Kawasaki ZX-10R 2:06.267
21. Randy Pagaud (Team OGP) Kawasaki ZX-10R 2:06.706
22. Philippe Thiriet (Team Brazil by ASPI) Kawasaki ZX-10R 2:07.087
23. Massimo Parziani (M.V. Racing Team) Aprilia RSV4 APRC 2:07.677
24. Robbie Brown (DMC Racing) Ducati 1199 Panigale 2:07.928
25. Heber Pedrosa (Team Brazil by ASPI) Kawasaki ZX-10R 2:08.983
26. Bogdan Vrajitoru (CSM Bucharest) Kawasaki ZX-10R 2:08.993
27. Adrien Protat (FP Racing) Kawasaki ZX-10R 2:09.766